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Nat. Rev. Drug Discov. | 从设计到模拟再到优化:模拟指导临床试验开启药物开发加速新范式

现代临床试验正在采用越来越多的创新策略,包括适应性设计、生物标志物指导入组、主方案试验以及实时决策。这些方法有望加速药物发现并改善临床结局,但也会增加试验执行和设计理解的复杂度。模拟指导设计是一种强有力工具,可用于识别最适合回答研究问题的试验设计,并帮助研究团队理解和沟通设计在实际运行中的行为。

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Nat. Chem. Biol. | 蛋白质稳定性主要由单位点偏倚而非位点间协方差决定

近年来,基于多序列比对的Potts模型被广泛用于蛋白质设计和突变效应预测。传统观点认为,多序列比对中既包含单位点保守性,也包含残基之间的协同进化信息,两者共同决定蛋白质结构、稳定性和功能。因此,大多数基于Potts模型的设计策略都会同时优化单位点偏倚和位点间耦合项。然而,两类信息对于蛋白质稳定性的具体贡献一直缺乏直接实验验证。

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Nat. Protoc. | AI 对接终于走向可用平台?浙大团队打造CVSP-AIE 把AI虚拟筛选做成工作流

论文题目: Facilitating structure-based drug discovery with an artificial intelligence-driven virtual screening platform 期刊:Nature Protocols 年份: 2026 DOI: 10.1038/s41596-026-01389-z 作者: Shukai Gu, Xujun Zhang, Mengwu Xiao 等 研究类型: Protocol / 平台型工作 核心平台: Comprehensive VS Platform with AI Engine,简称 CVSP-AIE。论文明确指出,该平台集成 KarmaDock、CarsiDock 和 RTMScore 三个 AI 模型,提供网页端(https://cadd.zju.edu.cn/cvsp)与本地部署版本(https://github.com/shukai1997/HierVS),用于基于结构的虚拟筛选。

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Nat. Med. | 人工智能临床决策支持系统辅助遗传性视网膜疾病诊断:一项多中心随机试验

遗传性视网膜疾病(Inherited Retinal Diseases,IRDs)是一类由单基因突变导致的致盲性疾病,其精准诊断通常依赖复杂的临床表型分析、遗传检测以及多学科专家协作,导致诊断周期长、费用高且医疗资源需求巨大。研究人员开发了一种人工智能临床决策支持系统Retina4IRD,可根据彩色眼底照片、光学相干断层扫描(OCT)及患者临床信息预测17类遗传基因型,为遗传检测前的临床诊断提供辅助。该系统基于RETFound预训练视觉基础模型构建,在来自中国、韩国和波兰9家中心的1843例经基因检测确诊患者数据上完成训练和验证。随后,研究人员进一步开展一项多中心随机临床试验,共纳入300例疑似遗传性视网膜疾病患者,对比Retina4IRD辅助专家诊断与专家单独诊断的真实临床效果。结果显示,Retina4IRD辅助组Top-5基因预测准确率达到88.5%,显著高于专家单独诊断组的67.3%,同时明显改善后续诊疗决策质量,证明该系统能够作为遗传检测前的重要临床决策支持工具,提高遗传性视网膜疾病精准诊断效率。

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Nat. Comp. Sci. | 警惕大模型的过度自信陷阱—清华大学王童组应邀述评蛋白质语言模型预测新

蛋白质适应度用于量化单个氨基酸突变对蛋白质功能改变与表型修饰的诱导程度,是探究生物学底层机制、开展理性蛋白质设计以及酶工程改造的重要基础。尽管深度突变扫描是当前精准表征蛋白质适应度的标准实验方法,但其高耗时、高劳动力成本以及对特定实验检测体系高度依赖的特点,严重阻碍了其在多样化分子效应高通量评估中的泛化应用。为攻克这一现实难题,近年来,蛋白质语言模型已逐渐发展成为预测蛋白质适应度的核心计算方案。然而,蛋白质语言模型为何能够预测适应度、为何在自然语言处理领域中推崇的 “模型越大效果越好”的理念在这里并不成立,以及在何种条件下应当或不应当应用这类模型进行预测,长期以来仍有待系统解析。

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这篇 Nat Cardiovasc Res 把“心外膜 aging”拆到了单细胞状态层面|附 sc/snRNA 分层整合流程

核心结论:胎儿心外膜里有 migratory fibroblast-like EPDC 状态,富集 angiogenesis/EMT/ECM 基因模块和 WNT-FGF 分泌程序;健康成人心外膜基本只剩 mesothelial 状态,EPDC 样群体几乎消失,功能上更偏 immune/stress response。好消息是:hESC-derived epicardium 更像胎儿心外膜,这解释了它为什么能帮助心肌修复。

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Mario

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马里奥是站在游戏界顶峰的超人气多面角色。马里奥靠吃蘑菇成长,特征是大鼻子、头戴帽子、身穿背带裤,还留着胡子。与他的双胞胎兄弟路易基一起,长年担任任天堂的招牌角色。

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Rocky Linux

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Rocky Linux(中文名:洛基)是由Gregory Kurtzer于2020年12月发起的企业级Linux发行版,作为CentOS稳定版停止维护后与RHEL(Red Hat Enterprise Linux)完全兼容的开源替代方案,由社区拥有并管理,支持x86_64、aarch64等架构。其通过重新编译RHEL源代码提供长期稳定性,采用模块化包装和SELinux安全架构,默认包含GNOME桌面环境及XFS文件系统,支持十年生命周期更新。

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WebStorm 是jetbrains公司旗下一款JavaScript 开发工具。目前已经被广大中国JS开发者誉为“Web前端开发神器”、“最强大的HTML5编辑器”、“最智能的JavaScript IDE”等。与IntelliJ IDEA同源,继承了IntelliJ IDEA强大的JS部分的功能。

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