首页 文章 精选 留言 我的

精选列表

搜索[nature],共247篇文章
优秀的个人博客,低调大师

Nature|619372人循环代谢性状的遗传分析

尽管复杂疾病的全基因组关联研究(GWAS)通常会分析多达100多万人,但分子特征的研究却滞后了。在这里,研究对爱沙尼亚生物库和英国生物库中多达619,372名个体的249个循环代谢特征进行了GWAS荟萃分析。从8,398个趋同于共享基因和通路的位点中鉴定出88,127个常见和低频位点-性状关联。使用统计精细映射、系统表型共定位和顺孟德尔随机化,探索了代谢特征与疾病结果之间的假定因果关系。研究预测,尽管在观察性研究中,血浆支链氨基酸(BCAA)与2型糖尿病有关,,但通过靶向BCAA分解代谢途径降低BCAA水平不太可能降低2型糖尿病的风险。利用我们的大样本量和高质量的基因型插补,发现19.4%的自信精细定位变异的次要等位基因频率在0.1%到1%之间,这些变异在预测的错义和剪接改变变异中富集了两倍。研究结果强调了将低频变异整合到遗传关联研究中的价值。

优秀的个人博客,低调大师

Nature子刊:调节睡眠-觉醒节奏的脑细胞

维也纳医科大学大脑研究中心的一个研究小组在大脑中发现了一种特定的细胞群,该细胞群负责由精神兴奋剂引起的睡眠-觉醒节奏的变化。下丘脑中由分子定义的细胞群构成了调节大脑昼夜节律的控制点,并通过其活动控制精神兴奋剂的作用。通过这种神经机制,精神兴奋剂可以导致警觉性和活跃性的增加,即使是在昼夜节律的休息和睡眠期间。

优秀的个人博客,低调大师

Nature子刊:脑成像揭示“顿悟”的神经机制

大脑成像研究的最新成果揭示,洞察力的闪现并非仅令人愉悦,它们实际上会重塑大脑对信息的表征方式,并助力将这些信息深深刻入记忆。这项研究由美国杜克大学以及德国洪堡大学和汉堡大学的研究人员联合开展,其发现对教育领域具有深远意义,表明培养“尤里卡时刻”或许能够使学习效果超越课堂,实现长期记忆与知识的深度内化。

优秀的个人博客,低调大师

Nature Communications | 定量评估干旱造成的森林死亡面积

导读 越来越多的研究表明,干旱造成全球范围内大量的树木死亡,对森林生态系统的功能和服务价值造成了很大的影响。虽然干旱会影响植被的光合作用,并通过碳饥饿和水力衰竭直接引发树木死亡,但更为常见的是干旱和次生灾害的共同作用导致大规模的树木死亡。比如,高温干旱是病虫害出现的诱发因素,并可能进一步增加森林火灾的风险。在气候变化的情况下,干旱将变得更加频繁和严重,人们开始担心干旱是否会越来越容易诱发森林生态系统的崩溃。目前干旱导致森林死亡的研究多集中在定性评估的阶段,定量化的评估工作还很缺乏,因此,本文作者利用高分辨率的遥感数据定量评估了欧洲地区干旱造成的森林死亡面积。 原文信息 正文 图1.不同水分平衡条件下欧洲地区森林死亡的概率 首先作者分析了不同水分平衡条件下欧洲地区森林死亡的概率,水分平衡( climatic water balance,CWB)是指每个月总的降水量与潜在蒸散发的差值。结果表明,水分平衡条件与森林死亡率之间表现为阈值关系,当CWB低于气候平均值的-1.6个标准差时,森林死亡率急剧增加;低于-3.0个标准差时,森林死亡的概率为91.6%(83.8-97.5%)。 图2.1987~2016年欧洲地区森林死亡的主要区域 作者进一步分析了1987~2016年欧洲地区森林死亡的主要区域。结果表明干旱导致的森林死亡主要分布在:1992年中欧、1994年西班牙、1999年和2002年波罗的海国家、2000年东南欧、2003年中欧和西欧、2005年伊比利亚半岛、2006年中欧和芬兰、2007年和2012年东南欧和东欧等地区。 图3.1987~2016年欧洲地区森林死亡面积的年际变化 1987~2016年,欧洲地区由于干旱造成的森林死亡面积达到511,059公顷,森林死亡面积呈脉冲型分布,最为严重的五年为:2005年 (127,688 公顷),2003 年(103,311公顷),2006年(48,306公顷),2000年(34,026公顷),1994 年(33,075公顷)。 最后作者指出,本文提供了干旱造成大范围树木死亡的重要证据,并提出未来干旱的增加可能会进一步引发欧洲大范围的树木死亡。 相关阅读: GRL | 干旱相关研究精选 论文链接点击下方阅读原文 本文分享自微信公众号 - 气象杂货铺(meteogs)。如有侵权,请联系 support@oschina.cn 删除。本文参与“OSC源创计划”,欢迎正在阅读的你也加入,一起分享。

优秀的个人博客,低调大师

Nature | AlphaFold3接触建模实现精准DNA碱基编辑

DNA碱基编辑技术能够在不引入DNA双链断裂的情况下实现单碱基精确修饰,是当前基因治疗和遗传疾病研究的重要工具。然而,脱靶编辑始终限制着其进一步应用。传统提高编辑器特异性的策略主要依赖结构经验设计或定向进化,不仅研发周期长,而且往往面临编辑活性与编辑精度难以兼顾的问题。研究人员提出了一种基于AlphaFold3的新型人工智能框架——ContactSeek,通过分析AlphaFold3预测得到的蛋白质—DNA—RNA复合物接触概率(Contact Probability,CP),寻找决定脱靶识别的关键接触区域及关键氨基酸,从而指导高精度碱基编辑器设计。研究首先建立了全新的dI-profiling测序方法,对腺嘌呤碱基编辑器(ABE)的全基因组脱靶位点进行系统检测,再将这些真实脱靶序列输入AlphaFold3进行预测。结果发现,相较于传统三维结构预测,接触概率能够更加敏感地反映靶点与脱靶之间微小但重要的相互作用差异。基于这一特点,ContactSeek成功筛选出多个决定编辑特异性的关键残基,并构建出兼具高活性和极低脱靶效应的新型ABE和CBE编辑器,展示了人工智能辅助精准基因编辑的新范式。

优秀的个人博客,低调大师

Nature|科学家发现慢性疼痛难题有望破解!

在当今快节奏的生活中,慢性疼痛似乎已经成了许多人难以摆脱的“影子”,无论是长时间伏案工作后的腰酸背痛,还是因疾病引发的持续性不适,慢性疼痛不仅影响着我们的生活质量,还给社会带来了沉重的经济负担。有数据显示,全球约有五分之一的成年人受到慢性疼痛的困扰,而慢性疼痛更是全球致残的首要原因。现有的治疗手段往往因疗效有限、耐受性差等问题难以满足需求。

优秀的个人博客,低调大师

Nature | 通用细胞嵌入构建细胞生物学基础模型

随着单细胞RNA测序技术的发展,研究人员已经构建了覆盖多种组织、发育阶段和物种的大规模细胞图谱,为建立统一的细胞表示空间提供了前所未有的数据基础。然而,不同实验平台、组织来源和物种之间存在显著的批次效应和基因组成差异,使现有分析方法往往需要针对每个新数据集重新训练模型,难以形成真正通用的细胞表示。

优秀的个人博客,低调大师

Nature|美洲原住民的演化历史与独特遗传多样性

美洲是人类扩散史上最后一块大陆,但美洲原住民的基因组研究在全球主要人群中恰恰是最薄弱的一环。长期以来,SNP芯片数据的内在偏差、样本覆盖的地理局限,以及对 Suruí、Karitiana 等少数人群的过度使用,使得许多关键问题悬而未决。这篇文章发布了迄今规模最大的美洲原住民高覆盖度全基因组数据集(128 个个体,~44×),横跨 8 个拉丁美洲国家、45 个人群、28 个语系,并系统整合了古代 DNA 数据展开分析。对于做人类群体基因组、演化或医学相关研究的同学,这篇文章无论在数据资源还是方法参考上都很有价值。

优秀的个人博客,低调大师

Nature Genetics|发育中人类大脑的单细胞蛋白质组景观

在复杂人类组织中以单细胞分辨率分析蛋白质丰度和动态具有挑战性。鉴于人类大脑皮层研究中转录本与蛋白质丰度的不一致,研究者开发了一种优化工作流程,结合无标记单细胞质谱与精确样本准备,解析发育中大脑单个细胞的定量蛋白质组。这个方法即使在小型未成熟的胎前人类神经元(直径约7–10微米,~50 pg蛋白)中,也能实现深度蛋白质组覆盖(每细胞约800个蛋白质),捕捉主要脑细胞类型,并实现单细胞分辨率下的全蛋白质组特性分析。

优秀的个人博客,低调大师

Nature | 把 RoseTTAFold 变成生成模型:RFdiffusion 的方法细节、实验结果与局限

RFdiffusion 是 AI 蛋白设计领域非常值得精读的一篇工作。它的核心贡献不是简单把扩散模型搬到蛋白上,而是把 RoseTTAFold 这类结构预测网络改造成蛋白骨架生成器,让模型从随机残基框架出发,逐步去噪生成可设计、可折叠、可实验验证的蛋白结构。更重要的是,它不只生成单体蛋白,还能根据对称性、靶蛋白界面、功能基序和酶活性位点等条件进行定向设计。本文将详细拆解 RFdiffusion 的问题背景、模型表示、扩散过程、条件生成机制、ProteinMPNN 后处理、AlphaFold2 过滤、实验验证结果,并讨论它在真实 AI 制药与蛋白工程中的价值和边界。

资源下载

更多资源
Mario

Mario

马里奥是站在游戏界顶峰的超人气多面角色。马里奥靠吃蘑菇成长,特征是大鼻子、头戴帽子、身穿背带裤,还留着胡子。与他的双胞胎兄弟路易基一起,长年担任任天堂的招牌角色。

Nacos

Nacos

Nacos /nɑ:kəʊs/ 是 Dynamic Naming and Configuration Service 的首字母简称,一个易于构建 AI Agent 应用的动态服务发现、配置管理和AI智能体管理平台。Nacos 致力于帮助您发现、配置和管理微服务及AI智能体应用。Nacos 提供了一组简单易用的特性集,帮助您快速实现动态服务发现、服务配置、服务元数据、流量管理。Nacos 帮助您更敏捷和容易地构建、交付和管理微服务平台。

Spring

Spring

Spring框架(Spring Framework)是由Rod Johnson于2002年提出的开源Java企业级应用框架,旨在通过使用JavaBean替代传统EJB实现方式降低企业级编程开发的复杂性。该框架基于简单性、可测试性和松耦合性设计理念,提供核心容器、应用上下文、数据访问集成等模块,支持整合Hibernate、Struts等第三方框架,其适用范围不仅限于服务器端开发,绝大多数Java应用均可从中受益。

Sublime Text

Sublime Text

Sublime Text具有漂亮的用户界面和强大的功能,例如代码缩略图,Python的插件,代码段等。还可自定义键绑定,菜单和工具栏。Sublime Text 的主要功能包括:拼写检查,书签,完整的 Python API , Goto 功能,即时项目切换,多选择,多窗口等等。Sublime Text 是一个跨平台的编辑器,同时支持Windows、Linux、Mac OS X等操作系统。

用户登录
用户注册