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Hadoop入门进阶课程5--MapReduce原理及操作

2017-11-07 520

本文版权归作者和博客园共有，欢迎转载，但未经作者同意必须保留此段声明，且在文章页面明显位置给出原文连接，博主为石山园，博客地址为 http://www.cnblogs.com/shishanyuan  。该系列课程是应邀实验楼整理编写的，这里需要赞一下实验楼提供了学习的新方式，可以边看博客边上机实验，课程地址为 https://www.shiyanlou.com/courses/237

【注】该系列所使用到安装包、测试数据和代码均可在百度网盘下载，具体地址为http://pan.baidu.com/s/10PnDs，下载该PDF文件

1、环境说明

部署节点操作系统为CentOS，防火墙和SElinux禁用，创建了一个shiyanlou用户并在系统根目录下创建/app目录，用于存放Hadoop等组件运行包。因为该目录用于安装hadoop等组件程序，用户对shiyanlou必须赋予rwx权限（一般做法是root用户在根目录下创建/app目录，并修改该目录拥有者为shiyanlou(chown –R shiyanlou:shiyanlou /app）。

Hadoop搭建环境：

l  虚拟机操作系统： CentOS6.6  64位，单核，1G内存

l  JDK：1.7.0_55 64位

l  Hadoop：1.1.2

2、MapReduce原理

2.1 MapReduce简介

MapReduce 是现今一个非常流行的分布式计算框架，它被设计用于并行计算海量数据。第一个提出该技术框架的是Google 公司，而Google 的灵感则来自于函数式编程语言，如LISP，Scheme，ML 等。MapReduce 框架的核心步骤主要分两部分：Map 和Reduce。当你向MapReduce 框架提交一个计算作业时，它会首先把计算作业拆分成若干个Map 任务，然后分配到不同的节点上去执行，每一个Map 任务处理输入数据中的一部分，当Map 任务完成后，它会生成一些中间文件，这些中间文件将会作为Reduce 任务的输入数据。Reduce 任务的主要目标就是把前面若干个Map 的输出汇总到一起并输出。从高层抽象来看，MapReduce的数据流图如下图所示：

clip_image001[4]

2.2 MapReduce流程分析

clip_image003[4]

 

2.2.1 Map过程

1. 每个输入分片会让一个map任务来处理，默认情况下，以HDFS的一个块的大小（默认为64M）为一个分片，当然我们也可以设置块的大小。map输出的结果会暂且放在一个环形内存缓冲区中（该缓冲区的大小默认为100M，由io.sort.mb属性控制），当该缓冲区快要溢出时（默认为缓冲区大小的80%，由io.sort.spill.percent属性控制），会在本地文件系统中创建一个溢出文件，将该缓冲区中的数据写入这个文件；

2. 在写入磁盘之前，线程首先根据reduce任务的数目将数据划分为相同数目的分区，也就是一个reduce任务对应一个分区的数据。这样做是为了避免有些reduce任务分配到大量数据，而有些reduce任务却分到很少数据，甚至没有分到数据的尴尬局面。其实分区就是对数据进行hash的过程。然后对每个分区中的数据进行排序，如果此时设置了Combiner，将排序后的结果进行Combia操作，这样做的目的是让尽可能少的数据写入到磁盘；

3. 当map任务输出最后一个记录时，可能会有很多的溢出文件，这时需要将这些文件合并。合并的过程中会不断地进行排序和combia操作，目的有两个：

l尽量减少每次写入磁盘的数据量

l尽量减少下一复制阶段网络传输的数据量。最后合并成了一个已分区且已排序的文件。为了减少网络传输的数据量，这里可以将数据压缩，只要将mapred.compress.map.out设置为true就可以了

4. 将分区中的数据拷贝给相对应的reduce任务。有人可能会问：分区中的数据怎么知道它对应的reduce是哪个呢？其实map任务一直和其父TaskTracker保持联系，而TaskTracker又一直和JobTracker保持心跳。所以JobTracker中保存了整个集群中的宏观信息。只要reduce任务向JobTracker获取对应的map输出位置就可以了。

2.2.2 Reduce过程

1. Reduce会接收到不同map任务传来的数据，并且每个map传来的数据都是有序的。如果reduce端接受的数据量相当小，则直接存储在内存中（缓冲区大小由mapred.job.shuffle.input.buffer.percent属性控制，表示用作此用途的堆空间的百分比），如果数据量超过了该缓冲区大小的一定比例（由mapred.job.shuffle.merge.percent决定），则对数据合并后溢写到磁盘中；

2. 随着溢写文件的增多，后台线程会将它们合并成一个更大的有序的文件，这样做是为了给后面的合并节省时间。其实不管在map端还是reduce端，MapReduce都是反复地执行排序，合并操作；

3. 合并的过程中会产生许多的中间文件（写入磁盘了），但MapReduce会让写入磁盘的数据尽可能地少，并且最后一次合并的结果并没有写入磁盘，而是直接输入到reduce函数。

2.3 MapReduce工作机制剖析

clip_image005[4]

1.在集群中的任意一个节点提交MapReduce程序；

2.JobClient收到作业后，JobClient向JobTracker请求获取一个Job ID；

3.将运行作业所需要的资源文件复制到HDFS上（包括MapReduce程序打包的JAR文件、配置文件和客户端计算所得的输入划分信息），这些文件都存放在JobTracker专门为该作业创建的文件夹中，文件夹名为该作业的Job ID；

4.获得作业ID后，提交作业；

5.JobTracker接收到作业后，将其放在一个作业队列里，等待作业调度器对其进行调度，当作业调度器根据自己的调度算法调度到该作业时，会根据输入划分信息为每个划分创建一个map任务，并将map任务分配给TaskTracker执行；

6.对于map和reduce任务，TaskTracker根据主机核的数量和内存的大小有固定数量的map槽和reduce槽。这里需要强调的是：map任务不是随随便便地分配给某个TaskTracker的，这里有个概念叫：数据本地化（Data-Local）。意思是：将map任务分配给含有该map处理的数据块的TaskTracker上，同时将程序JAR包复制到该TaskTracker上来运行，这叫“运算移动，数据不移动”；

7.TaskTracker每隔一段时间会给JobTracker发送一个心跳，告诉JobTracker它依然在运行，同时心跳中还携带着很多的信息，比如当前map任务完成的进度等信息。当JobTracker收到作业的最后一个任务完成信息时，便把该作业设置成“成功”。当JobClient查询状态时，它将得知任务已完成，便显示一条消息给用户；

8.运行的TaskTracker从HDFS中获取运行所需要的资源，这些资源包括MapReduce程序打包的JAR文件、配置文件和客户端计算所得的输入划分等信息；

9.TaskTracker获取资源后启动新的JVM虚拟机；

10.  运行每一个任务；

3、测试例子1

3.1 测试例子1内容

下载气象数据集部分数据，写一个Map-Reduce作业，求每年的最低温度

3.2 运行代码

3.2.1 MinTemperature

复制代码 
 1 import org.apache.hadoop.fs.Path;
 2 import org.apache.hadoop.io.IntWritable;
 3 import org.apache.hadoop.io.Text;
 4 import org.apache.hadoop.mapreduce.Job;
 5 import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat;
 6 import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.FileOutputFormat;
 7 
 8 public class MinTemperature {
 9     
10     public static void main(String[] args) throws Exception {
11         if(args.length != 2) {
12             System.err.println("Usage: MinTemperature<input path> <output path>");
13             System.exit(-1);
14         }
15         
16         Job job = new Job();
17         job.setJarByClass(MinTemperature.class);
18         job.setJobName("Min temperature");
19         FileInputFormat.addInputPath(job, new Path(args[0]));
20         FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(args[1]));
21         job.setMapperClass(MinTemperatureMapper.class);
22         job.setReducerClass(MinTemperatureReducer.class);
23         job.setOutputKeyClass(Text.class);
24         job.setOutputValueClass(IntWritable.class);
25         System.exit(job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1);
26     }
27 }
复制代码

3.2.2 MinTemperatureMapper

复制代码 
 1 import java.io.IOException;
 2 import org.apache.hadoop.io.IntWritable;
 3 import org.apache.hadoop.io.LongWritable;
 4 import org.apache.hadoop.io.Text;
 5 import org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper;
 6 
 7 public class MinTemperatureMapper extends Mapper<LongWritable, Text, Text, IntWritable>{
 8 
 9     private static final int MISSING = 9999;
10     
11     @Override 
12     public void map(LongWritable key, Text value, Context context) throws IOException, InterruptedException {
13         
14         String line = value.toString();
15         String year = line.substring(15, 19);
16         
17         int airTemperature;
18         if(line.charAt(87) == '+') {
19             airTemperature = Integer.parseInt(line.substring(88, 92));
20         } else {
21             airTemperature = Integer.parseInt(line.substring(87, 92));
22         }
23         
24         String quality = line.substring(92, 93);
25         if(airTemperature != MISSING && quality.matches("[01459]")) {
26             context.write(new Text(year), new IntWritable(airTemperature));
27         }
28     }
29 }
复制代码

3.2.3 MinTemperatureReducer

复制代码 
 1 import java.io.IOException;
 2 import org.apache.hadoop.io.IntWritable;
 3 import org.apache.hadoop.io.Text;
 4 import org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer;
 5 
 6 public class MinTemperatureReducer extends Reducer<Text, IntWritable, Text, IntWritable> {
 7 
 8     @Override
 9     public void reduce(Text key, Iterable<IntWritable> values, Context context) throws IOException, InterruptedException {
10         
11         int minValue = Integer.MAX_VALUE;
12         for(IntWritable value : values) {
13             minValue = Math.min(minValue, value.get());
14         }
15         context.write(key, new IntWritable(minValue));
16     }
17 }
复制代码

3.3 实现过程

3.3.1 编写代码

进入/app/hadoop-1.1.2/myclass目录，在该目录中建立MinTemperature.java、MinTemperatureMapper.java和MinTemperatureReducer.java代码文件，执行命令如下：

cd /app/hadoop-1.1.2/myclass/

vi MinTemperature.java

vi MinTemperatureMapper.java

vi MinTemperatureReducer.java

MinTemperature.java：

clip_image007[4]

MinTemperatureMapper.java：

clip_image009[4]

MinTemperatureReducer.java:

clip_image011[4]

3.3.2 编译代码

在/app/hadoop-1.1.2/myclass目录中，使用如下命令对java代码进行编译，为保证编译成功，加入classpath变量，引入hadoop-core-1.1.2.jar包：

javac -classpath ../hadoop-core-1.1.2.jar *.java

clip_image013[4]

3.3.3 打包编译文件

把编译好class文件打包，否则在执行过程会发生错误。把打好的包移动到上级目录并删除编译好的class文件：

jar cvf ./MinTemperature.jar ./Min*.class

mv *.jar ..

rm Min*.class

clip_image015[4]

3.3.4 解压气象数据并上传到HDFS中

把NCDC气象数据解压，并使用zcat命令把这些数据文件解压并合并到一个temperature.txt文件中

cd /home/shiyanlou

unzip temperature

cd temperature

zcat *.gz > temperature.txt

clip_image017[4]

clip_image019[4]

气象数据具体的下载地址为 ftp://ftp3.ncdc.noaa.gov/pub/data/noaa/ ，该数据包括1900年到现在所有年份的气象数据，大小大概有70多个G，为了测试简单，我们这里选取一部分的数据进行测试。合并后把这个文件上传到HDFS文件系统的/class5/in目录中：

hadoop fs -mkdir -p /class5/in

hadoop fs -copyFromLocal temperature.txt /class5/in

hadoop fs -ls /class5/in

clip_image021[4]

3.3.5 运行程序

以jar的方式启动MapReduce任务，执行输出目录为/class5/out：

cd /app/hadoop-1.1.2

hadoop jar MinTemperature.jar MinTemperature /class5/in/temperature.txt  /class5/out

clip_image023[4]

3.3.6 查看结果

执行成功后，查看/class5/out目录中是否存在运行结果，使用cat查看结果（温度需要除以10）：

hadoop fs -ls /class5/out

hadoop fs -cat /class5/out/part-r-00000

clip_image025[4]

3.3.7 通过页面结果（由于实验楼环境是命令行界面，以下仅为说明运行过程和结果可以通过界面进行查看）

1.查看jobtracker.jsp

http://XX. XXX.XX.XXX:50030/jobtracker.jsp

clip_image027[4]

查看已经完成的作业任务：

clip_image029[4]

任务的详细信息：

clip_image031[4]

 

2.  查看dfshealth.jsp

http://XX. XXX.XX.XXX:50070/dfshealth.jsp

clip_image033[4]

分别查看HDFS文件系统和日志

clip_image035[4]

clip_image037[4]

 

4、测试例子2

4.1 测试例子2内容

如果求温度的平均值，能使用combiner吗？有没有变通的方法？

4.2 回答

不能直接使用，因为求平均值和前面求最值存在差异，各局部最值的最值还是等于整体的最值的，但是对于平均值而言，各局部平均值的平均值将不再是整体的平均值了，所以不能直接用combiner。可以通过变通的办法使用combiner来计算平均值，即在combiner的键值对中不直接存储最后的平均值，而是存储所有值的和个数，最后在reducer输出时再用和除以个数得到平均值。

4.3 程序代码

4.3.1 AvgTemperature.java

复制代码 
 1 import org.apache.hadoop.fs.Path;
 2 import org.apache.hadoop.io.IntWritable;
 3 import org.apache.hadoop.io.Text;
 4 import org.apache.hadoop.mapreduce.Job;
 5 import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat;
 6 import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.FileOutputFormat;
 7 
 8 public class AvgTemperature {
 9     
10     public static void main(String[] args) throws Exception {
11          
12         if(args.length != 2) {
13             System.out.println("Usage: AvgTemperatrue <input path><output path>");
14             System.exit(-1);
15         }
16         
17         Job job = new Job();
18         job.setJarByClass(AvgTemperature.class);
19         job.setJobName("Avg Temperature");
20         FileInputFormat.addInputPath(job, new Path(args[0]));
21         FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(args[1]));
22         
23         job.setMapperClass(AvgTemperatureMapper.class);
24         job.setCombinerClass(AvgTemperatureCombiner.class);
25         job.setReducerClass(AvgTemperatureReducer.class);
26         
27         job.setMapOutputKeyClass(Text.class);
28         job.setMapOutputValueClass(Text.class);
29         
30         job.setOutputKeyClass(Text.class);
31         job.setOutputValueClass(IntWritable.class);
32         
33         System.exit(job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1);
34     }
35 }
复制代码

 4.3.2 AvgTemperatureMapper.java

复制代码 
 1 import java.io.IOException;
 2 import org.apache.hadoop.io.IntWritable;
 3 import org.apache.hadoop.io.LongWritable;
 4 import org.apache.hadoop.io.Text;
 5 import org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper;
 6 
 7 public class AvgTemperatureMapper extends Mapper<LongWritable, Text, Text, Text> {
 8 
 9     private static final int MISSING = 9999;
10     
11     @Override
12     public void map(LongWritable key, Text value, Context context) throws IOException, InterruptedException{
13         
14         String line = value.toString();
15         String year = line.substring(15, 19);
16         
17         int airTemperature;
18         if(line.charAt(87) == '+') {
19             airTemperature = Integer.parseInt(line.substring(88, 92));
20         } else {
21             airTemperature =  Integer.parseInt(line.substring(87, 92));
22         }
23         
24         String quality = line.substring(92, 93);
25         if(airTemperature != MISSING && !quality.matches("[01459]")) {
26             context.write(new Text(year), new Text(String.valueOf(airTemperature)));
27         }
28     }
29 }
复制代码

 4.3.3 AvgTemperatureCombiner.java

复制代码 
 1 import java.io.IOException;
 2 import org.apache.hadoop.io.Text;
 3 import org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer;
 4 
 5 public class AvgTemperatureCombiner extends Reducer<Text, Text, Text, Text>{
 6 
 7     @Override
 8     public void reduce(Text key, Iterable<Text> values, Context context) throws IOException, InterruptedException {
 9         
10         double sumValue = 0;
11         long numValue = 0;
12         
13         for(Text value : values) {
14             sumValue += Double.parseDouble(value.toString());
15             numValue ++;
16         }
17         
18         context.write(key, new Text(String.valueOf(sumValue) + ',' + String.valueOf(numValue)));
19     }
20 }
复制代码

 4.3.4 AvgTemperatureReducer.java

复制代码 
 1 import java.io.IOException;
 2 import org.apache.hadoop.io.IntWritable;
 3 import org.apache.hadoop.io.Text;
 4 import org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer;
 5 
 6 public class AvgTemperatureReducer extends Reducer<Text, Text, Text, IntWritable>{
 7 
 8     @Override
 9     public void reduce(Text key, Iterable<Text> values, Context context) throws IOException, InterruptedException {
10         
11         double sumValue = 0;
12         long numValue = 0;
13         int avgValue = 0;
14         
15         for(Text value : values) {
16             String[] valueAll = value.toString().split(",");
17             sumValue += Double.parseDouble(valueAll[0]);
18             numValue += Integer.parseInt(valueAll[1]);
19         }
20         
21         avgValue  = (int)(sumValue/numValue);
22         context.write(key, new IntWritable(avgValue));
23     }
24 }
复制代码

4.4  实现过程

4.4.1 编写代码

进入/app/hadoop-1.1.2/myclass目录，在该目录中建立AvgTemperature.java、AvgTemperatureMapper.java、AvgTemperatureCombiner.java和AvgTemperatureReducer.java代码文件，代码内容为4.3所示，执行命令如下：

cd /app/hadoop-1.1.2/myclass/

vi AvgTemperature.java

vi AvgTemperatureMapper.java

vi AvgTemperatureCombiner.java

vi AvgTemperatureReducer.java

AvgTemperature.java：

clip_image039[4]

AvgTemperatureMapper.java：

clip_image041[4]

AvgTemperatureCombiner.java：

clip_image043[4]

AvgTemperatureReducer.java:

clip_image045[4]

4.4.2 编译代码

在/app/hadoop-1.1.2/myclass目录中，使用如下命令对java代码进行编译，为保证编译成功，加入classpath变量，引入hadoop-core-1.1.2.jar包：

javac -classpath ../hadoop-core-1.1.2.jar Avg*.java

clip_image047[4]

4.4.3 打包编译文件

把编译好class文件打包，否则在执行过程会发生错误。把打好的包移动到上级目录并删除编译好的class文件：

jar cvf ./AvgTemperature.jar ./Avg*.class

ls

mv *.jar ..

rm Avg*.class

clip_image049[4]

4.4.4 运行程序

数据使用作业2求每年最低温度的气象数据，数据在HDFS位置为/class5/in/temperature.txt，以jar的方式启动MapReduce任务，执行输出目录为/class5/out2：

cd /app/hadoop-1.1.2

hadoop jar AvgTemperature.jar AvgTemperature /class5/in/temperature.txt /class5/out2

clip_image051[4]

4.4.5 查看结果

执行成功后，查看/class5/out2目录中是否存在运行结果，使用cat查看结果（温度需要除以10）：

hadoop fs -ls /class5/out2

hadoop fs -cat /class5/out2/part-r-00000

clip_image053[4]









本文转自shishanyuan博客园博客，原文链接：  http://www.cnblogs.com/shishanyuan/p/4639519.html  ，如需转载请自行联系原作者



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Spark项目故障总结

1.OOM问题，reduce端的缓冲大小，太大的话，吃撑了，一下过来很多数据，容易OOM，默认48，可以改小哦。spark.reducer.maxSizeInFlight，48---》24 2.JVM-GC导致的shuffle文件拉取失败，shuffle file not found spark.shuffle.io.maxRetries 3 第一个参数，意思就是说，shuffle文件拉取的时候，如果没有拉取到（拉取失败），最多或重试几次（会重新拉取几次文件），默认是3次。 spark.shuffle.io.retryWait 5s 第二个参数，意思就是说，每一次重试拉取文件的时间间隔，默认是5s钟。 默认情况下，假如说第一个stage的executor正在进行漫长的full gc。第二个stage的executor尝试去拉取文件，结果没有拉取到，默认情况下，会反复重试拉取3次，每次间隔是五秒钟。最多只会等待3 * 5s = 15s。如果15s内，没有拉取到shuffle file。就会报出shuffle file not found。 spark.shuffle.io.maxRetr...
2017-11-08
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