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全球首款云计算平台来了!

本文讲的是全球首款云计算平台来了,云计算,这个时髦的IT术语和生命科学有啥关系?实验技术的不断创新,使研究规模和可获得的数据量急剧扩增,当普通实验室计算能力已不足以应付日益庞大的数据分析时,云计算提供了解决之道。首个新一代测序云计算的诞生,不单将有助于解决数据瓶颈问题,更为未来的实验室数据分析指出新的方向。 自从人类基因组计划以来,测序技术的进步可谓日新月异。过去倾全世界之力也需要耗时近10年才能完成的人类基因组测序,如今的新一代测序只需数日即可完成。但是,新一代测序(NGS)系统的最大挑战之一是需要高性能的计算设施,以支持(庞大的)数据分析和储存。设想,以100-200bp的序列读长,要拼接出整个基因组,那需要多么庞大的数据分析和存储!以华大基因为例,仅仅是数据分析就号称有3000人的团队。普通实验室哪里能有这个计算能力!怎么办? 云计算解决之道 地位,为将新一代测序技术普及到普通规模实验室,又推出小型新一代测序Miseq。深明数据分析是新一代测序技术之瓶颈,清楚地认识到普通实验室缺少高性能计算设施支持庞大的数据分析和储存,Illumina最新推出了为生物学家打造的新一代测序云计算平...

【转载】Docker 镜像优化与最佳实践

阿里云高级研发工程师御坂在云栖TechDay41期的线下沙龙活动中分享了Docker镜像优化与最佳实践。本文为沙龙内容回顾。 从Docker镜像存储的原理开始,针对镜像的存储、网络传输,介绍如何在构建中对这些关键点进行优化。并介绍Docker最新的多阶段构建的功能,以解决构建依赖的中间产物问题。 镜像概念 镜像是什么? 从一个比较具体的角度去看,镜像就是一个多层存储的文件,相较于普通的ISO系统镜像来说,分层存储会带来两个优点: 一个是分层存储的镜像比较容易扩展,比如我们可以基于一个Ubuntu镜像去构建我们的Nginx镜像,这样我们只需要在Ubuntu镜像的基础上面做一些Nginx的安装配置工作。一个Nginx镜像工作就算制作完成了,我们不需要从头开始去制作各种镜像。 另一点是可以优化镜像存储空间,假如我们有两个镜像,Tag1.0镜像和 T

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Rocky Linux(中文名:洛基)是由Gregory Kurtzer于2020年12月发起的企业级Linux发行版,作为CentOS稳定版停止维护后与RHEL(Red Hat Enterprise Linux)完全兼容的开源替代方案,由社区拥有并管理,支持x86_64、aarch64等架构。其通过重新编译RHEL源代码提供长期稳定性,采用模块化包装和SELinux安全架构,默认包含GNOME桌面环境及XFS文件系统,支持十年生命周期更新。

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