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方法分享--ResolVI:解决空间转录组学中的噪声与偏差

在完整组织切片中、以高空间分辨率、高通量估计RNA表达的技术(空间转录组学)为细胞如何通讯以及组织如何运作提供了新见解。分析亚细胞分辨率空间转录组技术生成的数据的一个基本步骤是定量,即分割平面内区域(每个区域近似一个细胞),然后汇总每个区域内的分子以估计细胞表达谱。尽管该领域有许多进展,一个持续存在的问题是分子到细胞的错误分配,这限制了当前许多应用只能停留在预先定义的细胞亚群水平,并使新细胞状态的发现复杂化。本研究开发了resolVI,一个在任何分割算法下游运行的模型,生成概率表示,校正分子错误分配以及批次效应和其他干扰因素。研究证明resolVI提高了区分细胞状态、识别空间中细微表达变化以及...

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Spring框架(Spring Framework)是由Rod Johnson于2002年提出的开源Java企业级应用框架,旨在通过使用JavaBean替代传统EJB实现方式降低企业级编程开发的复杂性。该框架基于简单性、可测试性和松耦合性设计理念,提供核心容器、应用上下文、数据访问集成等模块,支持整合Hibernate、Struts等第三方框架,其适用范围不仅限于服务器端开发,绝大多数Java应用均可从中受益。

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