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【云栖号案例 | 互联网】华大基因:打造精准医疗应用云平台日志方案

云栖号案例库:【点击查看更多上云案例】不知道怎么上云?看云栖号案例库,了解不同行业不同发展阶段的上云方案,助力你上云决策! 公司简介 华大基因是中国最领先的基因科技公司,华大基因为消除人类病痛、经济危机、国家灾难、濒危动物保护、缩小贫富差距等方面提供分子遗传层面的技术支持。目前,世界上只有两个国家的三个公司可以生产、量产临床级别的基因测序仪,华大基因是中国的唯一一家。我们在基因的产权研发方面从1999年开始做了很多的工作。在2014年,我们与阿里云有了初步的接触,在2015年上线了我国第一个基因云计算平台。 业务痛点 我们与阿里云合作是因为我们看到基因技术从过去的只在实验室中逐渐进入到广大群众的生活场景当中,不管是在医学健康方面、生殖健康方面、肿瘤防治方面、病原感染方面还是农业育种,以及与我们每个人息息相关的健康管理,基因技术已经取得越来越多的应用场景,在国产基因测序仪的助力之下,基因数据产生的体量也越来越庞大,远远的超出了原有的计算能力所能支持的范围。 解决方案 针对上述情况,华大基因业务逐步迁移到阿里云计算平台之上。 新的日志分析架构如页面下方架构图所示。 计算集群:本地IDC作为原始测序数据(FastQ)的计算集群。 存储:阿里云OSS用于比对结果数据和测序数据。在存储方面,我们也使用了阿里的产品,每年我们会产生非常多的基因数据,明年我们计划对十万人进行基因组的基因测序和分析,我们将与阿里云计算平台一起在2018年用国产测序仪完成计算、分析和交付。 大数据计算:批量计算、Maxcompute等一些异构计算方式,使我们原先需要几周甚至更长时间才能完成的计算任务在一两天内得以解决。在我们现在进行的百万人基因组项目中,阿里云的Maxcompute技术帮助我们大大加速了对于人群结构的分析速度的进展。 1.使用阿里云MaxCompute处理群体变异检测和人群遗传结构分析。2.通过BatchCompute完成数据质控和比对。 上云价值 另外,在对百万人的基因数据进行遗传结构分析时,我们需要把每一个人与剩余的所有人进行遗传距离计算,这个计算量是巨大的,计算复杂度已经远远超出了传统计算条件下硬件设备所能承受的能力范围,通过使用Maxcompute,我们已经在这方面取得了技术突破,其中,我们在几小时内就可以把一个人与十万人中所有遗传距离进行计算,计算成本大幅降低至1000美金以内,这样的例子我们还在不断的开发中,相信Maxcompute也会给我们带来更多的惊喜。 相关产品 大数据计算服务 · MaxCompute MaxCompute(原ODPS)是一项大数据计算服务,它能提供快速、完全托管的PB级数据仓库解决方案,使您可以经济并高效的分析处理海量数据。更多关于阿里云MaxCompute的介绍,参见MaxCompute产品详情页。 批量计算 批量计算(BatchCompute)是一种适用于大规模并行批处理作业的分布式云服务。BatchCompute可支持海量作业并发规模,系统自动完成资源管理,作业调度和数据加载,并按实际使用量计费。BatchCompute广泛应用于电影动画渲染、生物数据分析、多媒体转码、金融保险分析、科学计算等领域。 更多关于批量计算的介绍,参见批量计算产品详情页。 对象存储OSS 阿里云对象存储服务(Object Storage Service,简称 OSS),是阿里云提供的海量、安全、低成本、高可靠的云存储服务。其数据设计持久性不低于 99.9999999999%(12 个 9),服务设计可用性(或业务连续性)不低于 99.995%。 更多关于对象存储OSS的介绍,参见对象存储OSS产品详情页。 【云栖号在线课堂】每天都有产品技术专家分享! 在线课堂地址:https://yqh.aliyun.com/zhibo 立即加入社群,与专家面对面,及时了解课程最新动态! 【云栖号在线课堂 社群】https://c.tb.cn/F3.Z8gvnK

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Nacos /nɑ:kəʊs/ 是 Dynamic Naming and Configuration Service 的首字母简称,一个易于构建 AI Agent 应用的动态服务发现、配置管理和AI智能体管理平台。Nacos 致力于帮助您发现、配置和管理微服务及AI智能体应用。Nacos 提供了一组简单易用的特性集,帮助您快速实现动态服务发现、服务配置、服务元数据、流量管理。Nacos 帮助您更敏捷和容易地构建、交付和管理微服务平台。

Spring

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Spring框架(Spring Framework)是由Rod Johnson于2002年提出的开源Java企业级应用框架,旨在通过使用JavaBean替代传统EJB实现方式降低企业级编程开发的复杂性。该框架基于简单性、可测试性和松耦合性设计理念,提供核心容器、应用上下文、数据访问集成等模块,支持整合Hibernate、Struts等第三方框架,其适用范围不仅限于服务器端开发,绝大多数Java应用均可从中受益。

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Sublime Text具有漂亮的用户界面和强大的功能,例如代码缩略图,Python的插件,代码段等。还可自定义键绑定,菜单和工具栏。Sublime Text 的主要功能包括:拼写检查,书签,完整的 Python API , Goto 功能,即时项目切换,多选择,多窗口等等。Sublime Text 是一个跨平台的编辑器,同时支持Windows、Linux、Mac OS X等操作系统。

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