文献分享（xenium 5k）--跨物种单细胞肾脏表观基因组图谱揭示疾病中以上皮为主的衰老样状态
表观遗传衰老是慢性疾病的标志。虽然这种表观遗传变化可以在组织损伤后出现，但受影响的细胞类型在很大程度上仍不清楚。本研究构建了来自健康、损伤（人类）和衰老（小鼠）肾脏的DNA甲基化、染色质可及性和转录谱的跨物种单细胞多组学图谱。研究发现，患病肾脏中的肾小管上皮细胞表现出显著的加速表观遗传衰老，并表明这种病理状态反映了衰老过程中观察到的转录轨迹，由缺乏CpG岛的谱系特异性基因的优先失调驱动。在空间上，这些表观遗传变化映射到未解决修复的病理生态位。单细胞DNA甲基化和3D基因组架构的联合分析揭示，疾病中的上皮修复状态经历显著的高阶基因组重组，同时伴随与肾功能下降相关的基因激活。总之，研究结果表征了协调的三维染色质结构内表观遗传抑制的丧失和局部甲基化组完整性的降低，这在衰老过程中损害上皮细胞身份并阻碍修复。
