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文献分享(xenium 5k)--跨物种单细胞肾脏表观基因组图谱揭示疾病中以上皮为主的衰老样状态

表观遗传衰老是慢性疾病的标志。虽然这种表观遗传变化可以在组织损伤后出现,但受影响的细胞类型在很大程度上仍不清楚。本研究构建了来自健康、损伤(人类)和衰老(小鼠)肾脏的DNA甲基化、染色质可及性和转录谱的跨物种单细胞多组学图谱。研究发现,患病肾脏中的肾小管上皮细胞表现出显著的加速表观遗传衰老,并表明这种病理状态反映了衰老过程中观察到的转录轨迹,由缺乏CpG岛的谱系特异性基因的优先失调驱动。在空间上,这些表观遗传变化映射到未解决修复的病理生态位。单细胞DNA甲基化和3D基因组架构的联合分析揭示,疾病中的上皮修复状态经历显著的高阶基因组重组,同时伴随与肾功能下降相关的基因激活。总之,研究结果表征了协调的三维染色质结构内表观遗传抑制的丧失和局部甲基化组完整性的降低,这在衰老过程中损害上皮细胞身份并阻碍修复。

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文献分享(xenium)--胰腺癌异质性与免疫逃逸中的丝氨酸蛋白酶抑制剂-髓系细胞轴

胰腺导管腺癌(PDAC)以高度免疫抑制、细胞外基质丰富的微环境为特征,但肿瘤表现出显著的异质性。这提出了一个问题:免疫抵抗是肿瘤的全局属性,还是在空间受限的生态位内组织起来的。本研究利用Perturb-map空间功能基因组学,确定了不同基因如何在空间和时间上塑造PDAC克隆的生长和细胞环境。该分析揭示了早期基因驱动的局部免疫邻域重塑,先于晚期空间克隆优势的出现。研究识别出SERPINE1(编码纤溶酶原激活物抑制剂1,PAI1)和SERPINB2(编码PAI2)作为肿瘤微环境控制和免疫逃逸的主要调控因子。这些丝氨酸蛋白酶抑制剂促进富含纤维蛋白的细胞外基质生态位的稳定,这些生态位在空间上保留巨噬细胞并将其编程为免疫抑制状态,同时排除细胞毒性T细胞。Serpine1或Serpinb2的缺失,或PAI1或CD18的药理学抑制,改善了小鼠的肿瘤控制,并与抗PD-1协同作用。患者肿瘤的多模态空间分析显示,免疫抑制生态位围绕罕见的SERPINB2和SERPINE1表达的PDAC亚群形成,以SPP1+/MARCO+巨噬细胞为主。这些发现将癌症来源的SERPINE1和SERPINB2识别为免疫抑制的局部空间组织者,将肿瘤内在异质性与局部微环境控制和PDAC免疫治疗耐药联系起来。

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Nacos

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Nacos /nɑ:kəʊs/ 是 Dynamic Naming and Configuration Service 的首字母简称,一个易于构建 AI Agent 应用的动态服务发现、配置管理和AI智能体管理平台。Nacos 致力于帮助您发现、配置和管理微服务及AI智能体应用。Nacos 提供了一组简单易用的特性集,帮助您快速实现动态服务发现、服务配置、服务元数据、流量管理。Nacos 帮助您更敏捷和容易地构建、交付和管理微服务平台。

Spring

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Spring框架(Spring Framework)是由Rod Johnson于2002年提出的开源Java企业级应用框架,旨在通过使用JavaBean替代传统EJB实现方式降低企业级编程开发的复杂性。该框架基于简单性、可测试性和松耦合性设计理念,提供核心容器、应用上下文、数据访问集成等模块,支持整合Hibernate、Struts等第三方框架,其适用范围不仅限于服务器端开发,绝大多数Java应用均可从中受益。

Sublime Text

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Sublime Text具有漂亮的用户界面和强大的功能,例如代码缩略图,Python的插件,代码段等。还可自定义键绑定,菜单和工具栏。Sublime Text 的主要功能包括:拼写检查,书签,完整的 Python API , Goto 功能,即时项目切换,多选择,多窗口等等。Sublime Text 是一个跨平台的编辑器,同时支持Windows、Linux、Mac OS X等操作系统。

WebStorm

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WebStorm 是jetbrains公司旗下一款JavaScript 开发工具。目前已经被广大中国JS开发者誉为“Web前端开发神器”、“最强大的HTML5编辑器”、“最智能的JavaScript IDE”等。与IntelliJ IDEA同源,继承了IntelliJ IDEA强大的JS部分的功能。

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