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【Spark Summit East 2017】加速云上Spark基因测序的数据驱动方法以及案例研究

更多精彩内容参见云栖社区大数据频道https://yq.aliyun.com/big-data;此外,通过Maxcompute及其配套产品,低廉的大数据分析仅需几步,详情访问https://www.aliyun.com/product/odps。 本讲义出自Lucy Lu与Eric Kaczmarek在Spark Summit East 2017上的演讲,主要介绍了正在研发中的基于Spark的编程平台GATK4(Genome Analysis Toolkit version 4 ),并用案例讲解了如何在云上配置Spark集群加速对于基因序列的测序工作。除此之外还介绍了名为PAT的内部数据分析框架,并介绍了如何使用PAT快速建立Spark与虚拟机合适的配置组合来优化对于云的硬件资源以及Spark计算并行性的使用。

【Spark Summit East 2017】Spark上基因组分析的算法和工具

更多精彩内容参见云栖社区大数据频道https://yq.aliyun.com/big-data;此外,通过Maxcompute及其配套产品,低廉的大数据分析仅需几步,详情访问https://www.aliyun.com/product/odps。 本讲义出自Ryan Williams在Spark Summit East 2017上的演讲,主要介绍了Hammer构建于Spark上的几个基因数据分析工具以及使用RDDs进行一般性计算的库,并分享了其中最有趣的几个应用程序和算法:Guacamole、Pageant以及Magic RDDs。

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Rocky Linux(中文名:洛基)是由Gregory Kurtzer于2020年12月发起的企业级Linux发行版,作为CentOS稳定版停止维护后与RHEL(Red Hat Enterprise Linux)完全兼容的开源替代方案,由社区拥有并管理,支持x86_64、aarch64等架构。其通过重新编译RHEL源代码提供长期稳定性,采用模块化包装和SELinux安全架构,默认包含GNOME桌面环境及XFS文件系统,支持十年生命周期更新。

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