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MaxCompute分布式计算如何提升基因大数据处理速率?

在2016杭州云栖大会首日,来自华大基因的基因组学数据专家黄树嘉在大数据专场分享了《基于数加MaxCompute的极速全基因组数据分析》,他主要从全基因组测序的背景与原理、传统单机分析流程的挑战、基于MaxCompute的方案三个方面进行了分享,详细介绍了华大基因运用阿里云处理海量的实践。 以下内容根据演讲PPT及现场分享整理。 什么是基因 基因是生命的基本因素,是人类和其他生物的基础遗传物质。细胞内有染色体,染色体是由一个一个的DNA碱基组成的,这些DNA碱基表现出来的是一个个的字符串。人共有23对染色体,有30亿个碱基对,我们在处理的过程中可以把它看作30亿量级的字符串。一个人拥有这么大的数据量,我们在对其进行解读的时候,为了保证数据的准确性,需要有几十层数据的解读。30亿个碱基对多么重要?一个人生老病死、健康与否的信息都会存储在基

安装hue-3.11.0

1) 配置HDFS HttpFS和WebHDFS 如果HDFS是HA方式部署的,则只能使用HttpFS,而不能用WebHDFS。 2) 安装依赖: apr-iconv-1.2.1 confuse-3.0 apr-util-1.5.4 libpng-1.6.26 apr-1.5.2 expat-2.2.0 pcre-8.38 libxml2-devel libxslt-devel sqlite-devel 。。。。。。 3) 编译安装Hue 解压Hue安装包,然后执行 make install PREFIX=/usr/local 进行安装! 可以考虑修改下Makefile.vars.priv中的INSTALL_DIR值为$(PREFIX),而不是默认的$(PREFIX)/hue, 这样改为执行: make install PREFIX=/usr/local/hue-3.11.0 带上版本号是个好习惯,安装好后再建一个软链接,如:ln -s /usr/local/hue-3.11.0 /usr/local/hue。 编译安装过程中最常遇到的是缺乏依赖库,只需要按提示进行补充然后重复继续即可...

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Spring框架(Spring Framework)是由Rod Johnson于2002年提出的开源Java企业级应用框架,旨在通过使用JavaBean替代传统EJB实现方式降低企业级编程开发的复杂性。该框架基于简单性、可测试性和松耦合性设计理念,提供核心容器、应用上下文、数据访问集成等模块,支持整合Hibernate、Struts等第三方框架,其适用范围不仅限于服务器端开发,绝大多数Java应用均可从中受益。

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Rocky Linux(中文名:洛基)是由Gregory Kurtzer于2020年12月发起的企业级Linux发行版,作为CentOS稳定版停止维护后与RHEL(Red Hat Enterprise Linux)完全兼容的开源替代方案,由社区拥有并管理,支持x86_64、aarch64等架构。其通过重新编译RHEL源代码提供长期稳定性,采用模块化包装和SELinux安全架构,默认包含GNOME桌面环境及XFS文件系统,支持十年生命周期更新。

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