时隔近 5 年，Gephi 0.9.3 发布

Gephi 0.9.3 现已发布，该软件的上一次版本发布是在 2017 年 9 月。Gephi 是一个用于可视化和操作大型图形的开源平台。它可以在 Windows、Mac OS X 和 Linux 上运行。有英语、法语、西班牙语、日语、俄语、巴西葡萄牙语、中文、捷克语和德语的本地化版本。 

版本更新内容如下：

New features

• 添加了 Statistical Inference 社区检测算法，Modularity 的更高级替代方案 #2431
• Windows 和 Linux 版本现在也嵌入了 JRE，因此不再需要单独安装 Java #2336
• 现在默认在所有平台上使用 FlatLaf 外观 #2415
• 分区中使用的颜色等外观属性现在保存在项目中 #1861
• Last Export settings 现在被保存为首选项，因此它们在不同的会话之间会持续存在 #1790

Bug 修复

• 改进 UI 以更好地适应 HighDPI 显示器 #2332
• 图形工具栏项目在较小的屏幕尺寸上重叠 #765
• 一些布局作用于 settled nodes #2385
• 忽略 GraphML desc standard tags #2030
• java.util.MissingResourceException gephi 版本 0.9.2 #2063
• 过滤具有空属性值的 datalab 列时出现 NullpointerException #2015
• 未选中“Create missing nodes”不会产生预期的效果#1878
• “Interval”未复制到新工作区#1988
• CSV Edges 文件未导入，因为 Gephi 未检测到 Source 和 Target 列#2178
• 删除节点时出现 ArrayIndexOutOfBoundsException #1623
• Gephic Mac 0.9.2 的 Appearance panel 中没有模式指示器 #2098
• Neighbors Network filter 在最大深度时冻结 #2099
• 无法导入大文件#1841
• 更新崩溃报告器并使其符合 GDPR #2340
• ClassCastException: org.gephi.graph.api.types.TimestampSet 不能转换为 org.gephi.graph.api.types.TimeMap #2297
• 在 GEXF 中支持 INF、-INF 的 double-type ±∞ values #2158
• 标准化时，大图的 Node betweenness 为负 #2139
• generatePalette 错误#2112
• 加载具有 0-weighted edges 的 gexf 文件会导致导入崩溃#1945
• 导出 VNA 图形文件时崩溃#1909
• 导入 CSV error edges #1848
• graphml 的导入仍然会混淆 d3 和 label 字段#1840
• 向 CSV 解析器添加对字节顺序标记的支持#1815
• 当字符串中的双引号用反斜杠分隔时，不再正确导入 CSV 文件#1812
• EdgeTypeFilter 上的 NullPointerException #1811
• GephiFormatException 会导致 ArrayIndexOutOfBoundsException: 0 #1810
• 在某些情况下，no-merge strategy 会出现异常。不应创建不兼容的 edge #1802
• NullPointerException: fileObject 参数不能为空#1789
• GephiFormatException：Gephi 保存项目失败。#1788
• ......

API 更改

• Graph API
  • 添加getEdges(int type)到Graph允许仅检索特定类型的 edges。
  • 添加getEdgeTypeLabels(boolean)到GraphModel.
  • 将 min/max 添加到TimeSet和Element.getTimeBounds()。
  • 添加Column.exists()为新实用程序。
  • 在Graph的 API 中添加GraphLock，以 expose locking states。
  • 让表成为列的集合。
  • 添加新方法Column.isDynamicAttribute()。
  • 除了toCollection()之外，在元素迭代器中添加toSet()。
  • 添加新Table.countColumns(Origin)方法。
  • 在提供 Table 时为 GraphModel 增加 getElementIndex() 方法。
  • 添加isNodeTable()和isEdgeTable()方法到Table.
• Appearance API（开发中）
  • Partition 和 Ranking 现在总是接收 Graph 作为参数，用于所有需要访问底层索引的方法，以促进本地规模支持。
  • 在 Ranking 中添加 getColumn()，使其与 Partition 保持一致
  • 在 Ranking 中添加 getNormalizedValue()，以便更容易地检索标准化的值。
  • 当没有找到给定值的颜色时，Partition 现在有一个静态的 DEFAULT_COLOR。
  • 删除Partition.setColors()，因为它容易引起混淆。
  • 添加transformAll(Iterable<? extends Element>)到Function.
  • 在 AppearanceModel 中将 isLocalScale() 拆分为 isRankingLocalScale() 和 isPartitionLocalScale()。
  • 让 AppearanceModel 中的 Function getters 独立于 Graph，因为这应该根据本地/全局状态自动处理。
• Preview API
  • 一个 postProcess() 方法已被添加到 Renderer SPI 中，以便在所有项目被 render 后进行自定义。

更多详情可查看：https://github.com/gephi/gephi/releases/tag/v0.9.3