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共同抗“疫” AWS加速新冠病毒的药物筛选

【51CTO.com原创稿件】 庚子年初,新型冠状病毒来袭,打乱了人们的工作和生活。除了“逆势前行”的医务工作者以外,还有更多的科研机构人员对病毒进行分析,筛选潜在药物和研发疫苗。上海交通大学陈海峰课题组便是其中的一员。 在新型冠状病毒疫情爆发时,陈教授课题组积极开展研究的准备工作,在对新型冠状病毒潜在药物筛选工作时,利用AWS的CPU实例快速搭建虚拟药物筛选流程,通过GPU实例搭建分子动力学模拟分析流程,从而找到有效的药物分子的成药可能性。 药物发现涉及多个阶段 并非易事 陈海峰课题组是隶属于上海交通大学生命科学技术学院生物信息学与生物统计学系和微生物代谢国家重点实验室的研究团队,其团队主要研究方向为虚拟药物筛选,分为两大方向,一是天然无规蛋白的精准分子力场研究,二是通过计算机辅助创新药物设计,找到药物和靶标蛋白之间的匹配关系,从而找到治疗某种特定疾病的相关药物。 上海交通大学陈海峰课题组 新型冠状病毒出现后,很多医疗机构和科研机构都在积极的找到应对病毒的药物,然而,新型病毒出现后,是需要多个阶段才能完成最终的药物发现,这并非易事。陈海峰教授介绍道:一个新的病毒出来后,首先我们将病毒...

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