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专题 | 金属结合蛋白的计算设计

金属结合蛋白能够参与多种生命过程,而金属在其中扮演着至关重要的角色。早在1996年,Holm等人就总结了金属结合位点的五大功能1。分别是:稳定蛋白质结构,调节蛋白质的构象;充当催化活性中心,辅助活化反应底物;传递电子;结合或运输小分子,比如参与氧气运输;储存金属离子,包括金属离子的摄取、缓冲和释放。不同类型的金属结合位点具有特异的结构特征,并赋予蛋白质多样的生理功能。而实现具有特定功能的金属结合蛋白设计,也成为蛋白质设计领域一个富有挑战的任务。

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NumPy 1.26.3 发布,Python 科学计算包

NumPy 1.26.3 现已发布,这是一个维护版本。修复了 1.26.2 发布后发现的错误和回归,最显著的变化是 f2py 的错误修复。此版本支持的 Python 版本为 3.9-3.12。 兼容性 f2py将不再接受不明确的组合-m和.pyfCLI 组合。当传递多个.pyf文件时,会引发错误。当同时传递-m和 a.pyf时,会发出警告并忽略-m提供的名称。 改进 f2py现在可以处理具有模块kind规范的common块。这进一步扩展了iso_fortran_env和iso_c_binding等内在函数的可用性。 此版本共合并了 42 个拉取请求,更多详情可查看发布说明。

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NumPy 1.22.4 发布,Python 科学计算包

NumPy 1.22.4 现已发布,这是一个维护版本,修复了在 1.22.3 版本之后发现的错误。此外,此版本的 wheels是使用最近发布的 Cython 0.29.30 构建的,它应该可以修复报告的调试问题。 此版本支持的 Python 版本为 3.8-3.10。Mac wheels现在基于 OS X 10.15,而不是以前 NumPy 发布周期中使用的 10.6。 此版本共合并了 22 个拉取请求: #21192:TST:将 mypy 从 0.931 升级到 0.940 #21243:MAINT:明确地重新导出 numpy._typing 中的类型 #21245:MAINT:为 CI doc 构建指定 sphinx、numpydoc 版本 #21275:BUG:修复错别字 #21277:ENH,BLD:修复 wasm 的数学特征检测 #21350:MAINT:修复失败的 simd 和 cygwin 测试 #21438:MAINT:修复失败的 Python 3.8 32 位 Windows 测试 #21445:BUG:允许旧 dtypes 再次转换为 datetime #21446:BUG:在 frombuffer 中使 mmap 处理更安全 #21447:BUG:停止使用 Python 3.11 中已弃用的 PyBytesObject.ob_shash #21448:ENH:引入 numpy.core.setup_common.NPY_CXX_FLAGS #21472:BUG:确保正确引发编译错误 #21473:BUG:修复分段错误 #21474:MAINT:更新文档要求 #21475:MAINT:在 clang 上用 no_sanitize("alignment") 标记 npy_memchr #21512: DOC:Proposal - 使文档登陆页面卡片更相似...... #21525:MAINT:将 Cython 版本更新为 0.29.30 #21536:BUG:修复构建配置期间的 GCC 错误 #21541:REL:为 NumPy 1.22.4 版本做准备 #21547:MAINT:跳过在 PyPy 上失败的测试 详情可查看:https://github.com/numpy/numpy/releases/tag/v1.22.4

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马里奥是站在游戏界顶峰的超人气多面角色。马里奥靠吃蘑菇成长,特征是大鼻子、头戴帽子、身穿背带裤,还留着胡子。与他的双胞胎兄弟路易基一起,长年担任任天堂的招牌角色。

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Sublime Text

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Sublime Text具有漂亮的用户界面和强大的功能,例如代码缩略图,Python的插件,代码段等。还可自定义键绑定,菜单和工具栏。Sublime Text 的主要功能包括:拼写检查,书签,完整的 Python API , Goto 功能,即时项目切换,多选择,多窗口等等。Sublime Text 是一个跨平台的编辑器,同时支持Windows、Linux、Mac OS X等操作系统。

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