python基础----动态生成类
type()函数用于动态生成类
type()总传递三个参数时为生成类
type(name, bases, dict)
name -- 类的名称。
bases -- 基类的元组。
dict -- 字典,类内定义的命名空间变量。
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Python 3.7.1的安装
Python简介 Python是一种跨平台、开源的、免费的、解释型的高级编程语言。应用领域很广泛,用于web开发、大数据处理、人工智能、自动化运维开发、云计算、爬虫、游戏开发等。 一、搭建Python安装环境 Windows:查看Windows系统是32位 或 64位,然后在Python官网下载对应的安装文件。 1.1 下载Python3.7.1(下载64位离线安装包) Python 3.7.1 - 2018-10-20Download Windows x86 web-based installerDownload Windows x86 executable installerDownload Windows x86 embeddable zip fileDownload Windows x86-64 web-based installer ——在线安装包Download Windows x86-64 executable installer ——离线安装包Download Windows x86-64 embeddable zip file ——嵌入式安装Download Wind...
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使用ALLMAPS进行辅助组装得到准染色体水平基因组
使用ALLMAPS进行辅助组装 简介 在从头组装过程中,确定基因组的scaffolds/contig的顺序和朝向是重建染色体非常关键的一步。这一步可以由多种辅助组装策略完成:例如遗传图谱, Hi-C, BioNano光学图谱,10X Chicago 。 一个物种可能会有多个遗传图谱,可以是不同项目中的不同定位群体结果,可以是不同软件如R/QTL, MSTMAP和JOINMAP的分析结果。遗传图谱会因重组率,偏分离(segregation distortion) , PAV(presence-absence variation)和染色体比对多态位点不同而发生变化。每一种图谱都能够提供不同的证据,举个例子,一个scaffold可能在一个图谱中无法被锚定,但是在另一个图谱中可以进行锚定,将这些图谱进行整合就能提最后染色体组装的精确度。 如果只用一个图谱,对scaffold进行排序只是计算量大一点而已,你需要根据图谱中分子标记在每个scaffold的平均距离进行排序就行。ALLMAPS, 正如名字说的那样,就是能够使用所有的图谱证据的工具,它能够计算scaffold的朝向,使其和已有的图谱的共...
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