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conda的安装与使用(最新版)

有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我gatk 3.8的版本在哪里下,下载好了之后怎么安装,我果断打开了https://bioconda.github.io/recipes ,告诉她安装conda吧,只要一行命令conda install gatk就行了。 然后她很可爱的问我conda怎么装。。果断就把这篇教程丢给她了,但是发现现在的用法和以前的不是很一样了,所以就把原来的教程更新了一下以飨读者。 你要的gatk conda简介 Conda 是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,用于安装多个版本的软件包及其依赖关系,并在它们之间轻松切换。 Conda 是为 Python 程序创建的,适用于 Linux,OS X 和Windows,也可以打包和分发其他软件。 安装conda conda分为anaconda和miniconda。anaconda是包含一些常用包的版本(这里的常用不代表你常用 微笑.jpg),miniconda则是精简版,需要啥装啥,所以推荐使用miniconda。...

pipenv 2018.7.1 版本'module' object is not callable' 问题解决

当使用 pipenv 在安装依赖包时,出现如下问题, > pipenv install Pipfile.lock (ca72e7) out of date, updating to (c2d5f0)... Locking [dev-packages] dependencies... Locking [packages] dependencies... python3.6/site-packages/pipenv/utils.py", line 402, in resolve_deps req_dir=req_dir File "/Users/helixcs/.pyenv/versions/3.6.5/lib/python3.6/site-packages/pipenv/utils.py", line 250, in actually_resolve_deps req = Requirement.from_line(dep) File "/Users/helixcs/.pyenv/versions/3.6.5/lib/python3.6/site-packages/pipenv/v...

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腾讯云软件源

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为解决软件依赖安装时官方源访问速度慢的问题,腾讯云为一些软件搭建了缓存服务。您可以通过使用腾讯云软件源站来提升依赖包的安装速度。为了方便用户自由搭建服务架构,目前腾讯云软件源站支持公网访问和内网访问。

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Rocky Linux(中文名:洛基)是由Gregory Kurtzer于2020年12月发起的企业级Linux发行版,作为CentOS稳定版停止维护后与RHEL(Red Hat Enterprise Linux)完全兼容的开源替代方案,由社区拥有并管理,支持x86_64、aarch64等架构。其通过重新编译RHEL源代码提供长期稳定性,采用模块化包装和SELinux安全架构,默认包含GNOME桌面环境及XFS文件系统,支持十年生命周期更新。

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