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文献分享(xenium 5k)--跨物种单细胞肾脏表观基因组图谱揭示疾病中以上皮为主的衰老样状态

表观遗传衰老是慢性疾病的标志。虽然这种表观遗传变化可以在组织损伤后出现,但受影响的细胞类型在很大程度上仍不清楚。本研究构建了来自健康、损伤(人类)和衰老(小鼠)肾脏的DNA甲基化、染色质可及性和转录谱的跨物种单细胞多组学图谱。研究发现,患病肾脏中的肾小管上皮细胞表现出显著的加速表观遗传衰老,并表明这种病理状态反映了衰老过程中观察到的转录轨迹,由缺乏CpG岛的谱系特异性基因的优先失调驱动。在空间上,这些表观遗传变化映射到未解决修复的病理生态位。单细胞DNA甲基化和3D基因组架构的联合分析揭示,疾病中的上皮修复状态经历显著的高阶基因组重组,同时伴随与肾功能下降相关的基因激活。总之,研究结果表征了协...

文献分享--人类面部多样性背后的细胞类型和调控元件图谱

人类遗传多样性产生了惊人的面部形状多样性,而颅面畸形是最常见的出生缺陷之一。识别介导基因组影响面部变异的细胞机制仍然是一个挑战。研究构建了一个跨越胚胎第6-11周的多模态面部图谱,提供单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学,全部在单细胞分辨率下。研究表征了56种细胞状态,在空间和时间上绘制了间充质亚型及其基因-增强子顺式调控景观。基因表达与面部特征的关联在早期间充质祖细胞中最强,逐渐变得更加区域限制。自相关分析揭示了定义间充质空间邻域的 patterning 基因,可能解释其附近变异的特征特异性。关键病理相关基因的增强子被发现可能是现代人类群体中产生面部变异的载体。其中一个与PAX1表达相...

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Rocky Linux(中文名:洛基)是由Gregory Kurtzer于2020年12月发起的企业级Linux发行版,作为CentOS稳定版停止维护后与RHEL(Red Hat Enterprise Linux)完全兼容的开源替代方案,由社区拥有并管理,支持x86_64、aarch64等架构。其通过重新编译RHEL源代码提供长期稳定性,采用模块化包装和SELinux安全架构,默认包含GNOME桌面环境及XFS文件系统,支持十年生命周期更新。

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WebStorm 是jetbrains公司旗下一款JavaScript 开发工具。目前已经被广大中国JS开发者誉为“Web前端开发神器”、“最强大的HTML5编辑器”、“最智能的JavaScript IDE”等。与IntelliJ IDEA同源,继承了IntelliJ IDEA强大的JS部分的功能。

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