课前准备--采用pyrosetta对autodock vina的分子对接结果进行优化
#### 作者,Evil Genius #### 接下来要为我们的生化课程,分子对接/分子动力学做好准备,大家学习分子对接/分子动力学,autodock vina、pyrosetta、Gromacs是必要要掌握的。 #### 这一篇我们来采用pyrosetta对autodock vina的分子对接结果进行优化/ #### 首先了解一下背景 ##### Vina 不是简单的“刚性对接”。 ###### 更准确地说,经典 AutoDock Vina 是 rigid receptor + flexible ligand:受体通常保持固定,而 ligand 的平移、旋转和可旋转键构象可以搜索。因此,V...