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Nucleic. Acids Res. | DeepAden: 基于深度学习的NRPS腺苷化结构域底物特异性预测方法

在天然产物研究中,非核糖体肽(NRP)是一类结构多样、活性丰富的重要天然产物,是临床药物先导化合物的重要来源。NRP的生物合成依赖于非核糖体肽合成酶(NRPS),其中腺苷化结构域(A domain)通过选择性识别和激活氨基酸底物来决定肽链核心结构。因此,准确预测A domain的底物特异性,对于理解NRP核心结构和生物合成逻辑至关重要。然而,现有预测工具面临两大瓶颈:一是基于单一共结晶结构(GrsA-Phe)定义的结合口袋残基在进化多样性A domain中的泛化能力有限,尤其是对非蛋白源底物的预测效果较差;二是底物数据严重不均衡,稀有底物样本匮乏,制约了模型的识别能力。

Nat. Comput. Sci. | 融合细胞学图像与空间转录组学的细胞分割方法

空间转录组技术的快速发展,使研究人员能够在组织原位测量基因表达,并逐步达到亚细胞乃至单细胞分辨率。然而,要将分散在组织空间中的转录本准确归属于单个细胞,首先需要可靠识别每个细胞的边界。不同组织的细胞形态、染色方式、成像质量和转录本密度差异明显,使现有细胞分割算法在复杂组织、密集细胞区域以及跨平台应用中仍存在较大局限。

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马里奥是站在游戏界顶峰的超人气多面角色。马里奥靠吃蘑菇成长,特征是大鼻子、头戴帽子、身穿背带裤,还留着胡子。与他的双胞胎兄弟路易基一起,长年担任任天堂的招牌角色。

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