【Spark Summit EU 2016】使用Spark轻松获取高产量基因组-低调大师

【Spark Summit EU 2016】使用Spark轻松获取高产量基因组

2017-02-13 576

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本讲义出自Erwin Datema与Roeland van Ham在Spark Summit EU 2016上的演讲，主要介绍了面对世界人口剧增所带来了粮食危机的巨大挑战，KeyGene公司希望通过基因变异改变农作物的基因来提升农作物的产量，而这一过程需要大数据技术以及高性能计算能力作为支撑，本讲义介绍了如何使用Spark和大数据分析获取农作物的高产量的基因组。

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访问云数据库HBase版的WebUI

访问云数据库HBase版的WebUI 一、查看访问机器的真实IP 直接浏览器打开如下网址：http://ifconfig.me/查看访问机器的真实IP，如下图：二、修改集群的网络白名单打开集群详情页面，点击修改网络白名单，如下图：在打开的页面中输入第一步查询到的真实IP，IP之间以英文的逗号分隔：三、设置WebUI访问的用户名和密码点击集群详情页中的“重置软件访问密码”按钮，设置访问WebUI的用户名和密码，需要注意的是，一个集群只能设置一个用于访问WebUI的用户名和密码，再次设置时，会覆盖原有的用户名和密码：四、点击链接跳转到WebUI进行访问! 点击集群详情页面上方的链接跳转到WebUI，目前支持HBase、HDFS和Ganglia的WebUI访问。

2017-02-14

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ELK5.0.1搭建用到的工具有： filebeat-5.0.1-linux-x86_64.tar.gz logstash-5.0.1.tar.gz elasticsearch-5.0.1.tar.gz kibana-5.0.1-linux-x86_64.tar.gz 以上4个工具可以https://www.elastic.co/downloads网址下的历史版本中找到。除此之外，ELK5.0.1对操作系统内核有要求，要求LINUX操作系统内核大于3.5，本次实验使用的linux操作系统是ORACLE LINUX6.6；另外，对JAVA JDK版本也有要求，最好安装jdk-8u111-linux-x64.tar.gz，可以在Oracle官方网站上找到并免费下载到。 linux主机需要修改的配置是： vi /etc/sysctl.conf vm.max_map_count = 262144 vi /etc/security/limits.conf * soft nofile 65536 * hard nofile 131072 * soft nproc 2048 * hard...

2017-02-14

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Spring框架（Spring Framework）是由Rod Johnson于2002年提出的开源Java企业级应用框架，旨在通过使用JavaBean替代传统EJB实现方式降低企业级编程开发的复杂性。该框架基于简单性、可测试性和松耦合性设计理念，提供核心容器、应用上下文、数据访问集成等模块，支持整合Hibernate、Struts等第三方框架，其适用范围不仅限于服务器端开发，绝大多数Java应用均可从中受益。

Rocky Linux

Rocky Linux（中文名：洛基）是由Gregory Kurtzer于2020年12月发起的企业级Linux发行版，作为CentOS稳定版停止维护后与RHEL（Red Hat Enterprise Linux）完全兼容的开源替代方案，由社区拥有并管理，支持x86_64、aarch64等架构。其通过重新编译RHEL源代码提供长期稳定性，采用模块化包装和SELinux安全架构，默认包含GNOME桌面环境及XFS文件系统，支持十年生命周期更新。