1.HBase依赖于HDFS,HBase按照列族将数据存储在不同的hdfs文件中；MongoDB直接存储在本地磁盘中,MongoDB不分列，整个文档都存储在一个（或者说一组）文件中 (存储)

2.Mongodb支持二级索引，而hbase本身不支持二级索引（查询）

3.HBase一个region只有一个HRegionServer对外提供服务，一旦这个region无法服务，则查询会失败；MongoDB的shards（类似于region）支持负载均衡,可以实现高可用 (存储)

4.HBase根据文件的大小来控制region的分裂,在hbase内部，存储时，数据按照Row key的字典序(byte order)排序存储；MongoDB根据负载来决定shards的分裂

5.mongodb的update是update-in-place，也就是原地更新，除非原地容纳不下更新后的数据记录。而hbase的修改和添加都是同一个命令：put，如果put传入的row key已经存在就更新原记录,实际上hbase内部也不是更新，它只是将这一份数据已不同的版本保存下来而已，hbase默认的保存版本的历史数量是3。

6.mongodb和hbase都支持mapreduce，不过mongodb的mapreduce很弱

7.mongodb支持shard分片，hbase根据row key自动负载均衡，这里shard key和row key的选取尽量用非递增的字段，尽量用分布均衡的字段

8.mongodb的读效率比写高，hbase默认适合写多读少的情况，可以通过hfile.block.cache.size配置 (查询)

9.hbase采用的LSM思想(Log-Structured Merge-Tree)，就是将对数据的更改hold在内存中，达到指定的threadhold后将该批更改merge后批量写入到磁盘，单个写变成批量写，大大提高了写入速度，读需要merge disk和memory中的数据，读的性能会有少量损失。mongodb采用的是mapfile+Journal思想，如果记录不在内存，先加载到内存，然后在内存中更改后记录日志，然后隔一段时间批量的写入data文件，这样对内存的要求较高，至少需要容纳下热点数据和索引